Информационное агентство
ВакансииИнтЕрвЬЮ
IT и медиа

Ученые предложили новый способ анализа ДНК

05 апреля 2016 09:15IT и медиа

Группа американских исследователей из Института Гладстона предложила новый способ анализа и интерпретации некодирующих учаcтков ДНК, которые авторы работы называют «темной материей» ДНК. Работа опубликована в Nature Genetics, кратко ознакомиться с ней можно на сайте EurekAlert!

С помощью вычислительного метода TargetFinder ученым удалось предсказать локализацию ДНК, которая не кодирует взаимодействие белков с генами. Технология позволяет сопоставить мутации в геномной «темной материи» с генами, на которые она влияет для выявление потенциальных мишеней локализации генетических нарушений.Ученые наблюдали фрагменты некодирующих ДНК, названных генами-усилителями (энхансерами), влияющими на уровень экспрессии определённых генов. Гены и энхансеры могут быть разделены длинными отрезками ДНК и располагаться на расстоянии друг от друга.

В ходе исследования для поиска закономерности взаимодействия гена и энхансера были проанализированы сотни наборов данных из шести типов клеток. В результате была получена модель, предсказывающая взаимодействие на 85%.«Большинство генетических мутаций происходят в энхансерах, что делает их очень важной областью для исследования. Долгое время мы пытались понять, как энхансер находит удаленные гены, на которые он действует», – отметила ведущий автор исследования Кэтрин Поллард. Ранее ученые считали, что энхансер действует на ген расположенный поблизости. Однако новое исследование показало, что энхансеры могут находить нужный ген, «перескакивая» через другие гены. Когда энхансер находится на расстоянии от гена, он влияет на него с помощью трехмерной петли.По словам ученых, результаты работу помогут при лечении разнообразных генетических заболеваний

Комментарии
Срочная новость   ⁄